O Paper é fork de plugin, e isso define o ecossistema
A linhagem é CraftBukkit, Spigot e Paper. Como o Paper preserva a API do Bukkit e do Spigot, o jar de um plugin compilado para Spigot arranca sem recompilar. É por isso que a base instalada de EssentialsX, LuckPerms, Vault e WorldGuard continua a funcionar depois da troca.
O que o Paper acrescenta é implementação, não uma API nova incompatível: chunk reescrito, motor de luz, rastreio de entidade, funis. Nada disso torna o tick paralelo, o ganho vem de cada tick custar menos. Trocar o jar rende uma melhoria real e limitada, e o resto depende da configuração e de que plugins aceita carregar.